媒体实验中心严格执行《高等学校仪器设备管理办法》、《暨南大学国有资产管理办法》、《暨南大学仪器设备管理规定》、《暨南大学教学科研仪器设备维修管理细则》等管理文件的精神，照章办事。在学校统一领导下，学院和中心共同制订实验示范中心管理条例。中心人员在中心主任的领导下共同制订中心发展规划、课程建设目标和实验教学要求，购置设备和实施实验教学。实验室的建设实行项目管理，每年度各实验室分别制订实验室规划、实验项目设置及其实验开放规划和经费使用计划，通过中心组织专家论证后实施，中途要检查，项目完成后要验收、评比。实验员负责实验仪器、设备、材料和物资的网上管理及其设备维护维修、保障实验室清洁卫生，防火、防盗安全，保证实验室资源共享，协调安排实验教学、科研和对社会服务的各项工作。实验中要求学生正确使用仪器设备，人为损坏仪器设备由个人赔偿。鼓励实验工作人员参与实验室建设和实验教学的研究探讨，提高实验技能和实验室管理水平。中心人员实行公开招聘、竞争上岗、定期考核的管理机制。中心成立以来一直重视制度建设，规范管理，学院和中心共同制订了有以下主要的规章制度：暨南大学固定资产管理办法暨南大学仪器设备管理规定暨南大
实验室工作人员业绩考核根据实验教师、实验技术人员岗位责任制及有关规章制度的基本要求，以实际工作表现和工作量为依据，按德、能、勤、绩四个部分进行实验教学的全面考核,考核结果直接交学校人事部门备案，与当年的校内工资挂钩。
为了保证媒体实验中心开出高质量的实验，课前要求教师认真备课、实验员作好实验前的准备工作，调试好实验设备，教研室主任进行督促检查，做到实验前的仪器设备完好率达100%。实验中要求学生正确使用仪器设备，养成良好的科学实验习惯，人为损坏仪器设备者照价赔偿，并作记录。平时要定期检查、维护好实验室仪器设备、管理好材料和物资，作好实验室安全防火、防盗工作。中心和教研室主任不定期地对实验课和实验报告进行听课抽查，保证实验课的质量。
学校对本中心提供了人力、财力、物力支持，保障中心的更新建设和良性运转。国有资产与设备处每年下拨实验设备经费用于实验设备的添置和更新，总务处每年根据实际需要下拨环境改造经费用于实验室环境改造和维修，国有资产与设备处每年还下拨设备维修专款和维持费用于大型专项设备的维修和实验室易耗材料的购置。另外校友、爱国人士捐赠部分设备或资金是实验室正常运作的补充。以上经费充分保障了媒体实验中心工作的正常运转。
